El área de asuntos ambientales tiene como objetivo fundamental el propiciar la rehabilitación del Estuario de la Bahía de San Juan, mejorar la calidad de sus aguas y el hábitat de su fauna y vida silvestre mediante el dragado y la canalización del recurso ecológico del Caño Martín Peña. Vigila y fomenta una cultura de conservación, sensibilidad y respeto a este cuerpo de agua. Además, desarrolla una conciencia de responsabilidad ciudadana en torno al impacto de la degradación ambiental sobre la calidad de vida de las comunidades. De igual forma, trabaja con la prevención y mitigación para reducir la vulnerabilidad de las comunidades frente a amenazas naturales u ocasionadas por la actividad humana, como las inundaciones, que son las más constantes en el Distrito.